Исследователи из Университета Отаго в Новой Зеландии создали инструмент, который позволяет быстро мутировать бактериофаги — вирусы, поражающие бактерии. Метод, описанный в журнале Nature Microbiology, даёт возможность учёным лучше понять, как работают фаги, и использовать их для борьбы с устойчивыми к антибиотикам инфекциями. Об этом сообщает издание Phys.org.
Профессор Питер Файнеран, старший автор работы, отмечает, что знания о фагах сейчас сопоставимы с пониманием антибиотиков в 1950-х годах. Многие гены фагов остаются «микробной тёмной материей», что ограничивает их применение в медицине и биотехнологии. Новый метод — «большой скачок» в изучении фаговой биологии.
Технология основана на CRISPR-Cas и транспозонном секвенировании. Она позволяет вносить мутации по всему геному фага и выявлять гены, необходимые для его выживания. Кроме того, метод даёт возможность добавлять в геном фага дополнительные гены, например, флуоресцентные маркеры или гены, повышающие терапевтический потенциал.
Доктор Лия Смит, соавтор исследования, подчёркивает, что это систематический и экономичный способ не только изучать функции генов, но и быстро конструировать фаги. Например, можно «оснастить» фаги дополнительными инструментами для преодоления защитных механизмов бактерий, что особенно важно для лечения инфекций, связанных с биоплёнками на имплантатах и медицинских устройствах.