ДНК-анализ выявил скрытых хозяев лесных экосистем — грибы-эпифиты

Под пологом леса скрывается огромная экосистема, где микроорганизмы играют ключевую роль в круговороте питательных веществ и секвестрации углерода. Ученые давно предполагали, что среди них есть виды-«хозяева», оказывающие непропорционально большое влияние на всю структуру сообщества, но выявить их было крайне сложно. Об этом рассказывает сайт Phys.org.

Команда исследователей из Киотского университета использовала современные технологии анализа ДНК, чтобы найти этих «скрытых дирижеров». Они собрали 1270 образцов корней в прохладном умеренном лесу в Сугадайре (префектура Нагано) и проанализировали данные о грибах и бактериях. С помощью суперкомпьютера и разработанного алгоритма ученые смоделировали микробные сообщества как единый ландшафт и выявили виды, способные кардинально менять его структуру. Результаты опубликованы в журнале Nature Communications.

Оказалось, что ключевую роль играют эндофиты — грибы, живущие внутри тканей растений. Ранее им уделяли мало внимания, но теперь выяснилось, что они существенно влияют на формирование грибных сообществ. «Даже один корень диаметром менее миллиметра содержит множество сосуществующих микроорганизмов», — отмечает первый автор исследования Микихито Ногути. Разработанные методы могут применяться для изучения других сложных микробиомов и в перспективе помогут управлять экосистемами с учетом всех их компонентов.