ИИ-инструмент MemBrain v2 ускоряет анализ клеточных мембран в десятки раз

Исследователи из Helmholtz Munich, Технического университета Мюнхена и Биоцентра Базельского университета разработали ИИ-инструмент MemBrain v2, который автоматизирует анализ клеточных мембран в 3D-изображениях. Работа, которая раньше занимала недели, теперь выполняется за несколько часов. Исследование опубликовано в журнале Nature Methods. Об этом пишет сайт Phys.org.

Инструмент находит мембраны, определяет расположение мембранных белков и анализирует их пространственную организацию. Для работы ему требуется минимальное количество обучающих данных или не требуется вовсе. В одном из тестов исследователи вручную разметили белковые комплексы на одной мембране, после чего инструмент локализовал их на других мембранах с F1-показателем 91%.

MemBrain v2 объединяет три этапа: обнаружение мембран (MemBrain-seg), поиск белков (MemBrain-pick) и измерение их расположения (MemBrain-stats). Ранее эти задачи выполнялись вручную, а существующие программы обрабатывали лишь отдельные части анализа. Инструмент доступен бесплатно и уже используется в исследованиях по всему миру, включая данные Института визуализации Чан Цукерберг.

В отдельном исследовании MemBrain v2 показал, что важные белки фотосинтеза пространственно разделены внутри мембраны, что ставит под сомнение прежние модели их организации. В будущем инструмент сможет точнее различать разные типы белков, что поможет лучше понять, как работают клетки и что меняется при развитии заболеваний.