Учёные создали ИИ-фермент для синтеза препарата против ВИЧ
Исследователи из Манчестерского института биотехнологии совместно с Институтом дизайна белков применили новую ИИ-модель RFD4-Proteina для создания ферментов, которые могут удешевить производство лекарств. Модель, разработанная IPD совместно с NVIDIA, генерирует новые белковые последовательности в 5–10 раз быстрее и с успешностью в 5–10 раз выше, чем предыдущие алгоритмы. Об этом сообщает издание Phys.org.
В ходе эксперимента учёные спроектировали ферменты для синтеза ленакапавира — препарата для профилактики ВИЧ. Из 67 вариантов, отобранных для тестирования, четыре показали активность, а лучший преобразовал 79% амина в нужный продукт. Фермент также продемонстрировал высокую селективность, что важно для сложной реакции, где необходимо подавить конкурирующее взаимодействие с водой.
RFD4-Proteina объединяет две ИИ-модели: RosettaFold Diffusion от IPD и Proteina-Complexa от NVIDIA. Она одновременно оптимизирует последовательность аминокислот, трёхмерную структуру белка и взаимодействия с другими молекулами. Модель доступна как открытый исходный код под лицензией BSD-3, что позволяет другим исследователям использовать её в своих разработках.
По словам профессора Дэвида Бейкера, лауреата Нобелевской премии по химии 2024 года, RFD4-Proteina откроет новые возможности в медицине, устойчивом развитии и биотехнологиях. Результаты работы опубликованы в виде препринта и подтверждают, что ИИ может создавать ферменты для сложных этапов синтеза активных фармацевтических ингредиентов.
